瓦谢尔计算生物研究院生物测序仪器招标公告

瓦谢尔计算生物研究院生物测序仪器招标公告

( 瓦谢尔计算生物研究院生物测序仪器采购项目 )需求公示

货物总清单

(一)货物总清单


序号


采购计划编号


货物名称


数量


单位


备注


财政预算限额(元)


1



生物测序实验设备


1



接受进口


10,400,000





备注:


1、备注栏注明“拒绝进口”的产品不接受投标人选用进口产品参与投标;注明“接受进口”的产品允许投标人选用进口产品参与投标,但不排斥国内产品。


2、以下产品均属于深圳市教学科研类设备允许进口产品政府采购清单。



(二)货物清单明细



序号


采购计划编号


货物名称


数量


单位


分项财政预算限额(元)


1



高通量定序仪


1



3,000,000.00


2


单细胞测序实验设备


1



2,000,000.00


3


高通量即时荧光定量PCR


1



700,000.00


4


DNA质谱阵列基因分析设备


1



3,000,000.00


5


微流体电泳分析仪


1



500,000.00


6


微型个人化定序设备


1



1,200,000.00


具体技术要求

说明:投标人须如实填写《技术规格偏离表》,并按招标文件的要求提供相关证明资料,包括产品原厂说明书或产品彩页等。提供的证明资料与投标响应情况不相符的,视为《技术规格偏离表》填写不实。



(说明:


1、“★”所标参数核心关键参数,负偏离1项将导致废标。


2、“▲”所标参数为专家进行综合评分的重要参数,但不作为废标条款。


3、如投标设备为进口货物,投标人需提供所投标产品厂家出具的授权书。




序号


货物名称


指标项


招标技术要求


1























高通量定序仪

















1.1 获得国家食品药品监督管理总局(CFDA)的中华人民共和国医疗器械注册证;


1.1.1▲ 获得医疗器械注册证,具有非常丰富的临床应用;


1.2 测序原理和支持测序应用


1.2.1 ★边合成边测序


1.2.2无创产前检测(NIPT)、全外显子组测序、全转录组测序、基因表达谱、靶向测序、人类全基因组测序;


1.3测序数据通量


1.3.1 ▲高通量模式:每次运行至少可生成400M条片段序列(Reads)120G碱基数据;


1.3.2 ▲中通量模式:每次运行至少可生成100M条片段序列(Reads)30G碱基数据;


1.4测序读长


▲支持SE75、SE150、PE75、PE150多种测序模式,最高可完成总长度300bp的DNA测序(双端之和)


1.5测序质量


1.5.1 以Q30为测序质量标准(即每个碱基的准确度为99.9%),80%以上的碱基比例达到Q30;


1.5.2 ▲可精确读取≥8个的连续单个重复碱基(如AAAAAAAAAA),准确性≥99%(50bp)


1.6模板扩增


测序的模板扩增过程为自动化,无需手工操作,且在同一台仪器上完成无需配置额外的设备;


1.7 测序结果


测序结果以碱基形式显示,方便数据的比对和分析;


1.8测序仪内置工作站


1.8.1 处理器:> 1.8GHz(8核);


1.8.2 内存:>95GB RAM;


1.8.3 硬盘:>740G(SSD和HDD);


1.8.4操作系统:Windows7(嵌入式系统)


1.9测序仪电源


1.9.1 电压100V(最小)至240V(最大);


1.9.2 电流10A(最小)至15A(最大),频率50/60HZ;


1.10测序仪工作环境


1.10.1 温度:19℃~25℃;


1.10.2 相对湿度:20~80%(无凝结);


1.11 配置


定序仪主机一台;清洗用芯片、试剂板、缓冲槽各1个;无线健盘1个;废液桶1个;泵接液盘1个等;


2





























单细胞测序实验设备










2.1长片段基因组测序技术









2.1.1 ★系统一次可以产生一百万个独立的液滴反应体系;


2.1.2 ▲系统提供四百万种不同的标注;


2.1.3 ▲样本处理通量:每次8个样本,满足平行实验的要求;


2.1.4 ▲提供基因组和单细胞应用相关试剂盒;


2.1.5 上机处理速度:<25分钟/次;


2.1.6 起始上样量:1-2ng初始DNA,节约了样本;


2.1.7 检测DNA长度:>20Kb,最长可达到100kb以上;


2.1.8 ▲可完成基因组的单倍型组装,可以获得数Mb的单倍型序列信息,明显提升基因组组装质量;


2.1.9 可研究基因组的结构变异,包括扩增,缺失,染色体易位等;


2.1.10 ★可研究基因组定向突变,可对90%以上的SNP完成定向分析;










2.2单细胞测序技术


2.2.1 ★产生不少于75万个独立的液滴反应体系;


2.2.2 提供不少于四百万种不同的标注;


2.2.3 ★捕获细胞数量:每个样本超过1000细胞,最多可达10000个细胞;


2.2.4 高细胞捕获效率:60%以上;


2.2.5 可完成单细胞3’转录组测序文库构建;


2.2.6 ▲可完成单细胞5’转录组测序文库构建;


2.2.7 ▲可完成单细胞T/B细胞VDJ全长区域测序文库构建;


2.2.8 ▲可完成单细胞基因组拷贝数检测测序文库构建;


2.2.9 ▲可完成单细胞表观遗传学ATAC测序文库构建;


2.2.10★高通量通量:一次可处理样本数量不少于8个;


2.2.11处理样本速度快:<10分钟;


2.2.12 ▲提供序列完整单细胞分析软件系统;







2.3 配套设备:基因扩增仪


2.3.1 ★模块结构:96孔0.2 ml专用合金模块(支持运行快速试剂)


2.3.2★梯度优化功能:可同时运行不低于6种不同退火温度的PCR程序,比传统的梯度PCR更有效的优化反应条件


2.3.3 ★最小/最大温度梯度:每相邻两列区域间温差最小为0.1℃,整个模块最小温差为0.5℃;每相邻2列区域间温差最大为5℃,整个模块最大温差为25℃






2.4 配套设备:全自动细胞分析仪


2.4.1 ★处理时间:<10秒,可以提供细胞总浓度、活细胞和死细胞浓度及其占总细胞数的比例、细胞活率、直径分布图和细胞显微图片;


2.4.2 ★可全自动对两种不同荧光通道的细胞进行计数,还可进行GFP/RFP表达分析、细胞凋亡、细胞活力及细胞周期分析;


2.4.3 ★光学: 3通道(明场 + 2 个 EVOS? LED光立方插槽),可选配2种光立方,有20种以上光立方可供选择;


2.4.4 ★具有细胞Gating功能:可对不同尺寸的细胞亚群进行计数




2.5 配套设备:超微量核酸蛋白荧光计


2.5.1 ★分子探针荧光染料,只与特定分子结合才发荧光,可专一性地定量dsDNA,ssDNA,RNA,microRNA和蛋白质;


2.5.2 ★高敏感度线性检测最低达到:dsDNA 0.01ng/ul, ssDNA 0.05ng/ul, RNA 0.25 ng/ul , 蛋白质12.5ng/μl;


2.5.3 ★可用于测定RNA IQ检测,测量RNA的完整性和质量




2.6 配置


单细胞测序实验设备主机一台;


超微量核酸蛋白荧光计一台;


基因扩增仪一台;


全自动细胞分析仪一台:


16次建库试剂盒、48次芯片以及96次index一套;


















3





















高通量即时荧光定量PCR


3.1 热循环系统


珀耳帖效应系统;


3.2★通道数


5色激发光滤光片和5色检测光滤光片,最多可同时检测5色荧光;可以升级至6色激发光通道和6色检测光通道,检测多达21种不同的荧光光谱;


3.3 ★模块规格


支持3种模块,? 标准96孔模块;? 快速96孔模块;? 384孔模块;可以升级至支持微流体芯片模块;



3.4 反应体积


3.4.1 标准96孔模式:10-100μL;


3.4.2 384孔模式:5-20μL;


3.5 支持耗材


3.5.1 国际标准96孔 (0.2 mL) 反应板与光学盖膜,0.2 mL八连管,0.2mL单管


3.5.2384孔反应板与光学盖膜


3.6 温控模块最高升温速率


6.5°C/秒(快速96孔模块), 4°C/秒(标准96孔模块), 3°C/秒(384孔模块)


3.7 温度控制


3.7.1 温控范围:4°C–100°C;


3.7.2 温度精确度:±0.25°C;


3.7.3 温度一致性:±0.50 °C;


3.8 高分辨熔解曲线分辨率


小至 0.04°C;


3.9 光学系统


高能量合金卤素灯(寿命2000小时)、5色激发滤光片,5色检测滤光片、冷CCD成像;


3.10 ★支持的荧光染料


FAM?, SYBR?, SYTO?9 (MeltDoctor?), Fluorescein, SYPRO? Orange,VIC?, JOE?, TET?, HEX?,TAMRA?, NED?, BODIPY? TMR-X,Texas Red?,LIZ?, Cy?5;


3.11 ★被动参照染料


软件支持Rox荧光校正;


3.12 数据同时采集


所有反应孔同时采集荧光数据,不同孔之间不存在时间差;


3.13 开放的API


开放的应用程序界面(API)允许整合第三方系统,如LIMS(实验室综合管理系统)或定制的自动化平台。可选的符合FDA 21 CFR Part 11法规的模块,以便数据的审查记录;


3.14 内置触摸屏电脑


LCD/ Full VGA (640x480)/32K 色。触摸屏电脑可备份还原超过100次的实验数据;仪器触摸屏提供了一键式的实验方案,可快速地设置多种应用;


3.15 已验证性能指标


3.15.1 动态范围:9 个对数的线性动态范围;


3.15.2 检测灵敏度:单拷贝检测/反应体系;


3.15.3 精密度:最低可分辨1.5倍拷贝数差异,置信度99.7%;


3.15.4 运行时间:~35分钟完成384孔板40个循环反应;










3.16软件支持应用


3.16.1 基于标准曲线的绝对定量 Standard curve (absolute quantitation);


3.16.2 相对标准曲线 Relative standard curve;


3.16.3 基于比较Ct值的相对定量 Comparative Ct (relative quantitation);


3.16.4 免费内置基因表达 (RQ) 相对定量分析功能,可同时分析100块板的实验数据,并用热点图和散点图提供数据质量的快速检查;


3.16.5 实时监控基因分型聚类分析:在基因分型实验中,能利用实时荧光定量PCR进程监控器优化基因分型运行程序设这,以确定聚类分析的理想循环;


3.16.6 融解曲线分析 Melt curve analysis (as a standalone application);


3.16.7 存在/不存在 Presence/Absence (Plus/minus);


3.16.8 基于或非基于实时扩增的基因分型 Genotyping (with or without real-time amplification);


3.16.9 ▲基于荧光定量PCR的蛋白表达分析功能,并提供同品牌原厂试剂和专门分析软件;


3.16.10 ▲基于荧光定量PCR的Non-coding RNA和microRNA分析,并提供同品牌原厂试剂和专门分析软件;


3.16.11 ▲基于荧光定量PCR的基因拷贝数(CNV)分析,并提供同品牌原厂试剂和专门分析软件;


3.16.12 ▲基于荧光定量PCR的肿瘤稀有突变分析,可检测占背景野生型细胞0.1%的微量突变细胞或DNA,并提供同品牌原厂试剂和专门分析软件;







3.17软件主要特点


3.17.1 设置向导/高级设置/快速启动


3.17.2 自动标准曲线建立


3.17.3 相对标准曲线


3.17.4 基因分型,数据和反应板读取


3.17.5 移液反应/反应体系设计


3.17.6 导出至 excel, powerpoint, jpeg


3.17.7 远程监控(最多可通过网络监测15台机器,并控制其中4台机器)和Email通知运行状态


3.17.8 高级分析选项,每孔手动基线设定


3.17.9 产品查询


3.18 配置


荧光定量PCR主机1台(自带96孔模块);


原装电脑 1台;


384孔模块 1个;


安装试剂盒 1套











4






















DNA质谱阵列基因分析设备



















4.1 质谱分析设备主机


4.1.1 ★配备基因分型软件。配合不同试剂,可完成单核苷酸多态性(SNP)、体细胞突变、碱基插入/缺失、拷贝数变异、基因融合、甲基化分析等多种应用,全自动实时数据获取和分析,直接提供SNP位点的核酸组成


4.1.2 可兼容全血、口腔拭子、石蜡包埋切片、细针穿刺活检样本(FNA)、循环游离DNA(cfDNA)、循环肿瘤细胞(CTC)等多种样本,可兼容严重降解的短片段模板,可检测降解到80 bp的DNA


4.1.3 同一个反应孔内,可同时完成至多40个多态性位点的多重检测,可检测三等位基因或四等位基因SNP


4.1.4利用10-20ng肿瘤DNA,对低频突变的检测灵敏度可达0.1%,并可进行突变频度的相对定量


4.1.5 ★提供免费的在线及离线设计软件,智能化自动设计基因分型及引物


4.1.6 ★多重PCR及单碱基延伸引物均无需荧光标记


4.1.7 实验结束后,软件自动进行等位基因报告及频度分析;针对多种试剂盒还可进行兼容HTML与Excel格式的自动整理与报告


4.1.8 提供针对肺癌、结直肠癌、黑色素瘤等多种肿瘤的实体肿瘤突变检测、与液体活检突变检测的即用型试剂盒,涵盖多达数百个致癌抑癌基因突变与靶向用药突变的同步灵敏检测


4.1.9 提供多种药物基因组学即用试剂盒,同步检测多达70个用药相关SNP和拷贝数变异


4.1.10 提供多种个性化定制服务,包括全套设计、优化、引物合成及后续技术支持


4.1.11 检测器:电子倍增管


4.1.12 检测通量:单次检测可兼容2块96芯片,单张芯片检测速度不高于1小时


4.2 微量分液


4.2.1 ★快速将样品转移到微阵列芯片上,样本转移时间不超过10分钟


4.2.2 ★同时可以放置2张芯片和2个96孔微孔板


4.2.3 ★分液体积:6-30nl


4.2.4 ★内置计算机控制机械手,将纳升级液体从PCR样品板转到到微阵列芯片


4.3 配置


4.3.1 DNA质谱分析主机一台


4.3.2 可实现基因分型软件包 一套


4.3.3 电脑显示屏 一台


4.3.4 微量分液系统 一台


5


















微流体电泳分析仪


5.1 功能


采用毛细管电泳原理,可应用于DNA、RNA等核酸的电泳分析,能进行全自动的核酸片段大小测定,核酸质控,NGS质检,浓度测定,微卫星分析等,具有蛋白电泳功能,蛋白大小/纯度等蛋白检测功能;


5.2 光源


LED光源、高灵敏的光电倍增管检测


5.3 自动化程度


采用预装式卡夹,即插即用,无须人工制胶、灌胶、上样,整个过程全部由仪器自动来完成;每轮分析后,仪器自动清洗毛细管,无须人工清洗;无需手工添加染料,无需人工更换毛细管模块


5.4 上样和通量


5.4.1 ★直接兼容常规单管0.2mlPCR管、常规8联管、12联管;可以直接96孔板上样;可搭配专用微量管,样品管中溶液需求量最低1ul;


5.4.2 样品上样量:小于0.1 ul;


5.4.3 ★可以一次性完成1-100个任意个数样品的检测分析不浪费试剂;可单次自动检测处理单个样本不造成浪费


5.5 电泳时间


分析时间:最快可达1-2分钟内完成一次电泳;


5.6 检测片段范围


15bp-40kb,可检测大于40 kb核酸样本


5.7 灵敏度


无需对样品进行纯化,可以直接对PCR产物原液进行检测。DNA样品的检测灵敏度可达2pg/ul;


5.8 卡夹


5.8.1 提供预制胶卡夹,适用于DNA高分辨率分析、DNA标准卡夹、DNA快速筛查分析、RNA质量控制分析等应用,具有蛋白卡夹;


5.8.2 可选择通卡夹配件,在仪器外部对卡夹进行通胶,可以对卡夹中毛细管中的胶进行更好的置换,对过期卡夹或者保存不当卡夹进行处理


5.9 分辨率


★对<500bp的DNA片段,可达1-4bp的分辨率,200bp片段可达2bp的分辨率;


5.10 软件功能


软件可以自动输出电泳胶图、峰图、样品浓度、片段大小等一系列数据,并可以以报告形式完整打印输出; PDF, WORD,JPG都可以输出;


5.11 无污染


系统中仪器、耗材及检测过程均为全封闭式,无污染;


5.12 压力装置


★采用空气压缩机或其他给压装置,操作方便,小巧便于放置和移动,无需氮气钢瓶,无需后期灌气;


5.13 配置清单


主机一台、操作电脑一台、分析软件一套、2个预制胶卡夹试剂盒、DNA Alignment Marker 1支、DNA SIZE Marker 1支、缓冲液试剂一套








6
























微型个人化定序设备


6.1测序原理


★系统采用最先进的半导体芯片测序,直接将化学信号转化为电信号,实时检测测序时产生的氢离子浓度;无激发光源,无需荧光标记,无需照相系统


6.2 通量


★有多种通量的测序芯片灵活可选,适合不同通量需求的应用。单次测序通量可达25Gb,并有进一步扩展的空间,测序Reads可达130M以上,目前已有的五种芯片通量分别是:


·510芯片(reads数目200-300万,在200 bp读长模式下可产生0.3-0.5 Gb数据,在400 bp读 长模式下可产生0.6-1.0 Gb数据)


·520芯片(reads数目300-600万,在200 bp读长模式下可产生0.6-1.0 Gb数据,在400 bp读长模式下可产生1.2-2.0 Gb数据,在600 bp读长模式下可产生0.5-1.5 Gb数据)


·530芯片(reads数目900-2,000万,在200 bp读长模式下可产生3.0-4.0 Gb数据,在400 bp读长模式下可产生6.0-8.0 Gb数据,在600 bp读长模式下可产生1.5-4.5 Gb数据)


·540芯片(reads数目6,000-8,000万,在200 bp读长模式下可产生10-15 Gb数据)


·550芯片(reads数目10,000-13,000万,在200 bp读长模式下可产生20-25 Gb数据)


6.3 读长


★单端测序长度不少于200 bp (510-550 芯片),520和530芯片单端读长可达600bp


6.4 数据量


★510芯片可产出1 Gb数据、520芯片可产出2 Gb数据、530芯片可产出7.2 Gb数据、540芯片可产出15 Gb数据、550芯片可产出25 Gb数据


6.5 测序周期(运行及分析)


★最快可在5.5小时内完成单端读长600 bp的测序及分析任务(520 芯片),可在3小时内完成单端读长200 bp的测序及分析任务,对于读长小于200 bp的测序及分析任务,则运行时间更短,其中,所有芯片均可在2.5小时内完成单端读长200 bp的测序任务,可在1张芯片上完成多样本和多位点的同时测序


6.6 灵活性


★拥有单独分离式的自动文库构建、模板制备系统以及测序系统,可并行处理,并且可以分步质控,保证高效测序


6.7 仪器设置时间


★提供带有RFID标签的即装即用试剂盒,装配设置时间少于15分钟


6.8 读取精度


★原始数据准确性≥99.0%


6.9 样本数量


★支持384个样本平行分析


6.10 客户定制服务


★可以同时完成6144重PCR反应,起始DNA量仅需10 ng,2.5小时内可以完成读长为200 bp的测序反应


6.11 配置


高通量测序设备一套、


高通量模板扩增富集设备一套、系统支持基于DNA- or RNA的应用的多达384个 barcoded 的文库,单人在一天内,可以完成不低于2个样品的模板扩增和富集、


模板制备和芯片上样设备一套 、提供仪器维护的有关资料一套



检测报告

样品要求及演示说明

评标信息


评标方法: 综合评分法


评标方法说明:


价格分=[1-(投标报价-最低价)/最低价]×价格权重×100


当价格分<0时,取0。



注:


1、评标信息为最新的货物类评标信息模板,请根据本项目实际需求进行修订;


2、评标信息模板说明:评分因素的设置须在本模板范围内;各评分因素有明确分值权重的不能更改;有明确权重范围的需在该范围内;评分因素中有可选项的,若不适用本项目的可删除。



序号


评分项


权重


1


价格


30


2


技术部分


55



序号


评分因素


权重


评分方式


评分准则


1


技术保障措施


5


专家打分


在投标文件中详细说明保障措施(包括技术团队、技术方案、技术人员、场地、车辆等),评审委员会根据响应情况进行横向比较,按优100分,良80分,中60分,差0分打分。


2


技术规格偏离情况


50


专家打分


投标人应如实填写《技术规格偏离表》,评审委员会根据技术需求参数响应情况进行打分,各项技术参数指标及要求全部满足的得100分。“★”所标参数为核心关键参数,负偏离1项将废标,“▲”所标参数为重要参数,每负偏离1项扣8分,其他参数每负偏离1项扣3分。


3


商务需求


7



序号


评分因素


权重


评分方式


评分准则


1


免费保修期内售后服务条款偏离情况


5


专家评分


投标人应如实填写《免费保修期内售后服务条款偏离表》,评审委员会根据响应情况进行打分,全部满足要求的得100分,每负偏离一项扣30分。


2


其他商务条款偏离情况


2


专家评分


投标人应如实填写《其他商务条款偏离表》,评审委员会根据响应情况进行打分,全部满足要求的得100分,每负偏离一项扣30分。


(“x”分值根据商务条款的数量综合设定,允许对重点参数与一般参数设定不同的扣分档次)。


4


综合实力部分


8



序号


评分因素


权重


评分方式


评分准则


1


投标人近三年同类业绩(截止日为本项目公告发布之日)


5


专家评分


提供3个同类业绩即得满分,提供2个得60分,提供1个得30分,未提供的不得分。投标人必须在投标文件中提供每一个完工项目的合同和验收报告,否则不得分。


2


履约评价


3


专家评分


根据深圳市政府采购履约评价库中的资料打分。履约评价无差评的得100分,有差评的得0分。


商务需求



序号


目录


招标商务需求


(一)免费保修期内售后服务要求


1


免费保修期


货物免费保修期 2年,时间自最终验收合格并交付使用之日起计算。


2


维修响应及故障解决时间


投标人须提供售后服务联系电话及联系人,免费质保期内,接到报障电话24小时内派工程技术人员上门维修。规定时间内未处理完毕的,投标人提供不低于同等档次货物供用户使用至故障货物能正常使用为止。如果需要更换配件的,要求更换的配件跟被更换的品牌、类型相一致或者是同类同档次的替代品,后者需征得用户方管理人员同意。如须增加非投标方的货物和配件,投标方应协助解决。


3


其他


到货后一周内完成安装并培训。


(二)免费保修期外售后服务要求(可选)


1




2




……




(三)其他商务要求


1


关于交货


1.1签订合同后 180 天(日历日)内。


1.2投标人必须承担的设备运输、安装调试、验收检测和提供设备操作说明书、图纸等其他类似的义务。


2


关于验收


2.1投标人货物经过双方检验认可后,签署验收报告,产品保修期自验收合格之日起算,由投标人提供产品保修文件。


2.2当满足以下条件时,采购人才向中标人签发货物验收报告:


a、中标人已按照合同规定提供了全部产品及完整的技术资料。


b、货物符合招标文件技术规格书的要求,性能满足要求。


c、货物具备产品合格证。


3


付款方式


合同签订且收到发票后支付合同总价的30%为预付款;货到指定地点后且安装验收合格后支付合同总价的70%。


注:开具正规发票即可,对发票种类无特殊要求。


……




……








备注:


1. “(一)免费保修期内售后服务要求”部分,请详细列明免费保修期内的售后服务要求,内容包括但不限于免费保修期限、售后服务人员配备、技术培训方案、质量保证、违约承诺、维修响应及故障解决时间、方案等。


2. “(二)免费保修期外售后服务要求”部分,请详细列明免费保修期外的售后服务要求,内容包括但不限于零配件的优惠率、维修响应及故障解决时间、方案、提供的服务等。


3. “(三)其他商务要求”部分,如有补充,请详细列明。


技术规格偏离表


说明:请根据所填的“具体技术要求”详细填写下表的“序号”、“货物名称”、“招标技术要求”方面的内容



序号


货物名称


指标项


招标技术要求


投标技术响应


偏离情况


说明


1















高通量定序仪

















1.1 获得国家食品药品监督管理总局(CFDA)的中华人民共和国医疗器械注册证;


1.1.1▲ 获得医疗器械注册证,具有非常丰富的临床应用;





1.2 测序原理和支持测序应用


1.2.1 ★边合成边测序


1.2.2无创产前检测(NIPT)、全外显子组测序、全转录组测序、基因表达谱、靶向测序、人类全基因组测序;





1.3测序数据通量


1.3.1 ▲高通量模式:每次运行至少可生成400M条片段序列(Reads)120G碱基数据;


1.3.2 ▲中通量模式:每次运行至少可生成100M条片段序列(Reads)30G碱基数据;





1.4测序读长


▲支持SE75、SE150、PE75、PE150多种测序模式,最高可完成总长度300bp的DNA测序(双端之和)





1.5测序质量


1.5.1 以Q30为测序质量标准(即每个碱基的准确度为99.9%),80%以上的碱基比例达到Q30;


1.5.2 ▲可精确读取≥8个的连续单个重复碱基(如AAAAAAAAAA),准确性≥99%(50bp)





1.6模板扩增


测序的模板扩增过程为自动化,无需手工操作,且在同一台仪器上完成无需配置额外的设备;





1.7 测序结果


测序结果以碱基形式显示,方便数据的比对和分析;





1.8测序仪内置工作站


1.8.1 处理器:> 1.8GHz(8核);


1.8.2 内存:>95GB RAM;


1.8.3 硬盘:>740G(SSD和HDD);


1.8.4操作系统:Windows7(嵌入式系统)





1.9测序仪电源


1.9.1 电压100V(最小)至240V(最大);


1.9.2 电流10A(最小)至15A(最大),频率50/60HZ;





1.10测序仪工作环境


1.10.1 温度:19℃~25℃;


1.10.2 相对湿度:20~80%(无凝结);





1.11 配置


定序仪主机一台;清洗用芯片、试剂板、缓冲槽各1个;无线健盘1个;废液桶1个;泵接液盘1个等;





2































单细胞测序实验设备










2.1长片段基因组测序技术









2.1.1 ★系统一次可以产生一百万个独立的液滴反应体系;


2.1.2 ▲系统提供四百万种不同的标注;


2.1.3 ▲样本处理通量:每次8个样本,满足平行实验的要求;


2.1.4 ▲提供基因组和单细胞应用相关试剂盒;


2.1.5 上机处理速度:<25分钟/次;


2.1.6 起始上样量:1-2ng初始DNA,节约了样本;


2.1.7 检测DNA长度:>20Kb,最长可达到100kb以上;


2.1.8 ▲可完成基因组的单倍型组装,可以获得数Mb的单倍型序列信息,明显提升基因组组装质量;


2.1.9 可研究基因组的结构变异,包括扩增,缺失,染色体易位等;


2.1.10★可研究基因组定向突变,可对90%以上的SNP完成定向分析;













2.2单细胞测序技术


2.2.1 ★产生不少于75万个独立的液滴反应体系;


2.2.2 提供不少于四百万种不同的标注;


2.2.3 ★捕获细胞数量:每个样本超过1000细胞,最多可达10000个细胞;


2.2.4 高细胞捕获效率:60%以上;


2.2.5 可完成单细胞3’转录组测序文库构建;


2.2.6 ▲可完成单细胞5’转录组测序文库构建;


2.2.7 ▲可完成单细胞T/B细胞VDJ全长区域测序文库构建;


2.2.8 ▲可完成单细胞基因组拷贝数检测测序文库构建;


2.2.9 ▲可完成单细胞表观遗传学ATAC测序文库构建;


2.2.10★高通量通量:一次可处理样本数量不少于8个;


2.2.11处理样本速度快:<10分钟;


2.2.12▲提供序列完整单细胞分析软件系统;










2.3 配套设备:基因扩增仪


2


2.2


2.3


2.3.1 ★模块结构:96孔0.2 ml专用合金模块(支持运行快速试剂)


2.3.2 ★梯度优化功能:专利技术,可同时运行不低于6种不同退火温度的PCR程序,比传统的梯度PCR更有效的优化反应条件


2.3.3 ★最小/最大温度梯度:每相邻两列区域间温差最小为0.1℃,整个模块最小温差为0.5℃;每相邻2列区域间温差最大为5℃,整个模块最大温差为25℃









2.4 配套设备:全自动细胞分析仪


2.4


2.4.1 ★处理时间:<10秒,可以提供细胞总浓度、活细胞和死细胞浓度及其占总细胞数的比例、细胞活率、直径分布图和细胞显微图片;


2.4.2 ★可全自动对两种不同荧光通道的细胞进行计数,还可进行GFP/RFP表达分析、细胞凋亡、细胞活力及细胞周期分析;


2.4.3 ★光学: 3通道(明场 + 2 个 EVOS? LED光立方插槽),可选配2种光立方,有20种以上光立方可供选择;


2.4.4 ★具有细胞Gating功能:可对不同尺寸的细胞亚群进行计数







2.5 配套设备:超微量核酸蛋白荧光计


2.5


2.5.1 ★分子探针荧光染料,只与特定分子结合才发荧光,可专一性地定量dsDNA,ssDNA,RNA,microRNA和蛋白质;


2.5.2 ★高敏感度线性检测最低达到:dsDNA 0.01ng/ul, ssDNA 0.05ng/ul, RNA 0.25 ng/ul , 蛋白质12.5ng/μl;


2.5.3 ★可用于测定RNA IQ检测,测量RNA的完整性和质量







2.6 配置


单细胞测序实验设备主机一台;


超微量核酸蛋白荧光计一台;


基因扩增仪一台;


全自动细胞分析仪一台:


16次建库试剂盒、48次芯片以及96次index一套;





3



























高通量即时荧光定量PCR


3.1 热循环系统


珀耳帖效应系统;





3.2★通道数


5色激发光滤光片和5色检测光滤光片,最多可同时检测5色荧光;可以升级至6色激发光通道和6色检测光通道,检测多达21种不同的荧光光谱;





3.3 ★模块规格


支持3种模块,? 标准96孔模块;? 快速96孔模块;? 384孔模块;可以升级至支持微流体芯片模块;






3.4 反应体积


3


3.2


3.3


3.4


3.4.1 标准96孔模式:10-100μL;


3.4.2 384孔模式:5-20μL;





3.5 支持耗材


3.5


3.5.1 国际标准96孔 (0.2 mL) 反应板与光学盖膜,0.2 mL八连管,0.2mL单管


3.5.2 384孔反应板与光学盖膜





3.6 温控模块最高升温速率


6.5°C/秒(快速96孔模块), 4°C/秒(标准96孔模块), 3°C/秒(384孔模块)





3.7 温度控制


3.6


3.7


3.7.1 温控范围:4°C–100°C;


3.7.2 温度精确度:±0.25°C;


3.7.3 温度一致性:±0.50 °C;





3.8 高分辨熔解曲线分辨率


小至 0.04°C;





3.9 光学系统


高能量合金卤素灯(寿命2000小时)、5色激发滤光片,5色检测滤光片、冷CCD成像;





3.10 ★支持的荧光染料


FAM?, SYBR?, SYTO?9 (MeltDoctor?), Fluorescein, SYPRO? Orange,VIC?, JOE?, TET?, HEX?,TAMRA?, NED?, BODIPY? TMR-X,Texas Red?,LIZ?, Cy?5;





3.11 ★被动参照染料


软件支持Rox荧光校正;





3.12 数据同时采集


所有反应孔同时采集荧光数据,不同孔之间不存在时间差;





3.13 开放的API


开放的应用程序界面(API)允许整合第三方系统,如LIMS(实验室综合管理系统)或定制的自动化平台。可选的符合FDA 21 CFR Part 11法规的模块,以便数据的审查记录;





3.14 内置触摸屏电脑


LCD/ Full VGA (640x480)/32K色。触摸屏电脑可备份还原超过100次的实验数据;仪器触摸屏提供了一键式的实验方案,可快速地设置多种应用;





3.15 已验证性能指标


3.8


3.9


3.10


3.11


3.12


3.13


3.14


3.15


3.15.1动态范围:9 个对数的线性动态范围;


3.15.2检测灵敏度:单拷贝检测/反应体系;


3.15.3精密度:最低可分辨1.5倍拷贝数差异,置信度99.7%;


3.15.4运行时间:~35分钟完成384孔板40个循环反应;













3.16软件支持应用


3.16


3.16.1基于标准曲线的绝对定量 Standard curve (absolute quantitation);


3.16.2相对标准曲线 Relative standard curve;


3.16.3基于比较Ct值的相对定量 Comparative Ct (relative quantitation);


3.16.4免费内置基因表达 (RQ) 相对定量分析功能,可同时分析100块板的实验数据,并用热点图和散点图提供数据质量的快速检查;


3.16.5实时监控基因分型聚类分析:在基因分型实验中,能利用实时荧光定量PCR进程监控器优化基因分型运行程序设这,以确定聚类分析的理想循环;


3.16.6融解曲线分析 Melt curve analysis (as a standalone application);


3.16.7存在/不存在 Presence/Absence (Plus/minus);


3.16.8基于或非基于实时扩增的基因分型 Genotyping (with or without real-time amplification);


3.16.9▲基于荧光定量PCR的蛋白表达分析功能,并提供同品牌原厂试剂和专门分析软件;


3.16.10▲基于荧光定量PCR的Non-coding RNA和microRNA分析,并提供同品牌原厂试剂和专门分析软件;


3.16.11▲基于荧光定量PCR的基因拷贝数(CNV)分析,并提供同品牌原厂试剂和专门分析软件;


3.16.12▲基于荧光定量PCR的肿瘤稀有突变分析,可检测占背景野生型细胞0.1%的微量突变细胞或DNA,并提供同品牌原厂试剂和专门分析软件;










3.17软件主要特点


3.17


3.17.1设置向导/高级设置/快速启动


3.17.2自动标准曲线建立


3.17.3相对标准曲线


3.17.4基因分型,数据和反应板读取


3.17.5移液反应/反应体系设计


3.17.6导出至 excel, powerpoint, jpeg


3.17.7远程监控(最多可通过网络监测15台机器,并控制其中4台机器)和Email通知运行状态


3.17.8高级分析选项,每孔手动基线设定


3.17.9产品查询





3.18 配置


荧光定量PCR主机1台(自带96孔模块);


原装电脑 1台;


384孔模块 1个;


安装试剂盒 1套














4














DNA质谱阵列基因分析设备



















4.1 质谱分析设备主机


4.1.1 ★配备基因分型软件。配合不同试剂,可完成单核苷酸多态性(SNP)、体细胞突变、碱基插入/缺失、拷贝数变异、基因融合、甲基化分析等多种应用,全自动实时数据获取和分析,直接提供SNP位点的核酸组成


4.1.2 可兼容全血、口腔拭子、石蜡包埋切片、细针穿刺活检样本(FNA)、循环游离DNA(cfDNA)、循环肿瘤细胞(CTC)等多种样本,可兼容严重降解的短片段模板,可检测降解到80 bp的DNA


4.1.3 同一个反应孔内,可同时完成至多40个多态性位点的多重检测,可检测三等位基因或四等位基因SNP


4.1.4利用10-20ng肿瘤DNA,对低频突变的检测灵敏度可达0.1%,并可进行突变频度的相对定量


4.1.5 ★提供免费的在线及离线设计软件,智能化自动设计基因分型及引物


4.1.6 ★多重PCR及单碱基延伸引物均无需荧光标记


4.1.7 实验结束后,软件自动进行等位基因报告及频度分析;针对多种试剂盒还可进行兼容HTML与Excel格式的自动整理与报告


4.1.8 提供针对肺癌、结直肠癌、黑色素瘤等多种肿瘤的实体肿瘤突变检测、与液体活检突变检测的即用型试剂盒,涵盖多达数百个致癌抑癌基因突变与靶向用药突变的同步灵敏检测


4.1.9 提供多种药物基因组学即用试剂盒,同步检测多达70个用药相关SNP和拷贝数变异


4.1.10 提供多种个性化定制服务,包括全套设计、优化、引物合成及后续技术支持


4.1.11 检测器:电子倍增管


4.1.12 检测通量:单次检测可兼容2块96芯片,单张芯片检测速度不高于1小时





4.2 微量分液


4.2.1 ★快速将样品转移到微阵列芯片上,样本转移时间不超过10分钟


4.2.2 ★同时可以放置2张芯片和2个96孔微孔板


4.2.3 ★分液体积:6-30nl


4.2.4 ★内置计算机控制机械手,将纳升级液体从PCR样品板转到到微阵列芯片





4.3 配置


4.3.1 DNA质谱分析主机一台


4.3.2 可实现基因分型软件包一套


4.3.3 电脑显示屏一台


4.3.4 微量分液系统一台





5



















微流体电泳分析仪


5.1 功能


采用毛细管电泳原理,可应用于DNA、RNA等核酸的电泳分析,能进行全自动的核酸片段大小测定,核酸质控,NGS质检,浓度测定,微卫星分析等,具有蛋白电泳功能,蛋白大小/纯度等蛋白检测功能;





5.2 光源


LED光源、高灵敏的光电倍增管检测





5.3 自动化程度


采用预装式卡夹,即插即用,无须人工制胶、灌胶、上样,整个过程全部由仪器自动来完成;每轮分析后,仪器自动清洗毛细管,无须人工清洗;无需手工添加染料,无需人工更换毛细管模块





5.4 上样和通量


5.4.1 ★直接兼容常规单管0.2mlPCR管、常规8联管、12联管;可以直接96孔板上样;可搭配专用微量管,样品管中溶液需求量最低1ul;


5.4.2 样品上样量:小于0.1 ul;


5.4.3 ★可以一次性完成1-100个任意个数样品的检测分析不浪费试剂;可单次自动检测处理单个样本不造成浪费





5.5 电泳时间


分析时间:最快可达1-2分钟内完成一次电泳;





5.6 检测片段范围


15bp-40kb,可检测大于40 kb核酸样本





5.7 灵敏度


无需对样品进行纯化,可以直接对PCR产物原液进行检测。DNA样品的检测灵敏度可达2pg/ul;





5.8 卡夹


5.8.1 提供预制胶卡夹,适用于DNA高分辨率分析、DNA标准卡夹、DNA快速筛查分析、RNA质量控制分析等应用,具有蛋白卡夹;


5.8.2 可选择通卡夹配件,在仪器外部对卡夹进行通胶,可以对卡夹中毛细管中的胶进行更好的置换,对过期卡夹或者保存不当卡夹进行处理





5.9 分辨率


★对<500bp的DNA片段,可达1-4bp的分辨率,200bp片段可达2bp的分辨率;





5.10 软件功能


软件可以自动输出电泳胶图、峰图、样品浓度、片段大小等一系列数据,并可以以报告形式完整打印输出; PDF, WORD,JPG都可以输出;





5.11 无污染


系统中仪器、耗材及检测过程均为全封闭式,无污染;





5.12 压力装置


★采用空气压缩机或其他给压装置,操作方便,小巧便于放置和移动,无需氮气钢瓶,无需后期灌气;





5.13 配置清单


主机一台、操作电脑一台、分析软件一套、2个预制胶卡夹试剂盒、DNA Alignment Marker 1支、DNA SIZE Marker 1支、缓冲液试剂一套


























6























微型个人化定序设备


6.1测序原理


★系统采用最先进的半导体芯片测序,直接将化学信号转化为电信号,实时检测测序时产生的氢离子浓度;无激发光源,无需荧光标记,无需照相系统





6.2 通量


★有多种通量的测序芯片灵活可选,适合不同通量需求的应用。单次测序通量可达25Gb,并有进一步扩展的空间,测序Reads可达130M以上,目前已有的五种芯片通量分别是:


·510芯片(reads数目200-300万,在200 bp读长模式下可产生0.3-0.5 Gb数据,在400 bp读 长模式下可产生0.6-1.0 Gb数据)


·520芯片(reads数目300-600万,在200 bp读长模式下可产生0.6-1.0 Gb数据,在400 bp读长模式下可产生1.2-2.0 Gb数据,在600 bp读长模式下可产生0.5-1.5 Gb数据)


·530芯片(reads数目900-2,000万,在200 bp读长模式下可产生3.0-4.0 Gb数据,在400 bp读长模式下可产生6.0-8.0 Gb数据,在600 bp读长模式下可产生1.5-4.5 Gb数据)


·540芯片(reads数目6,000-8,000万,在200 bp读长模式下可产生10-15 Gb数据)


·550芯片(reads数目10,000-13,000万,在200 bp读长模式下可产生20-25 Gb数据)





6.3 读长


★单端测序长度不少于200 bp (510-550 芯片),520和530芯片单端读长可达600bp





6.4 数据量


★510芯片可产出1 Gb数据、520芯片可产出2 Gb数据、530芯片可产出7.2 Gb数据、540芯片可产出15 Gb数据、550芯片可产出25 Gb数据





6.5 测序周期(运行及分析)


★最快可在5.5小时内完成单端读长600 bp的测序及分析任务(520 芯片),可在3小时内完成单端读长200 bp的测序及分析任务,对于读长小于200 bp的测序及分析任务,则运行时间更短,其中,所有芯片均可在2.5小时内完成单端读长200 bp的测序任务,可在1张芯片上完成多样本和多位点的同时测序





6.6 灵活性


★拥有单独分离式的自动文库构建、模板制备系统以及测序系统,可并行处理,并且可以分步质控,保证高效测序





6.7 仪器设置时间


★提供带有RFID标签的即装即用试剂盒,装配设置时间少于15分钟





6.8 读取精度


★原始数据准确性≥99.0%





6.9 样本数量


★支持384个样本平行分析





6.10 客户定制服务


★可以同时完成6144重PCR反应,起始DNA量仅需10 ng,2.5小时内可以完成读长为200 bp的测序反应





6.11配置


高通量测序设备一套、 高通量模板扩增富集设备一套、 系统支持基于DNA-or RNA的应用的多达384个 barcoded的文库,单人在一天内,可以完成不低于2个样品的模板扩增和富集、


模板制备和芯片上样设备一套 、提供仪器维护的有关资料一套





商务需求偏离表


序号


目录


招标商务条款


投标商务条款


偏离情况


说明


(一)免费保修期内售后服务条款偏离表


1


免费保修期


货物免费保修期 2 年,时间自最终验收合格并交付使用之日起计算。





2


维修响应及故障解决时间


投标人须提供售后服务联系电话及联系人,免费质保期内,接到报障电话24小时内派工程技术人员上门维修。规定时间内未处理完毕的,投标人提供不低于同等档次货物供用户使用至故障货物能正常使用为止。如果需要更换配件的,要求更换的配件跟被更换的品牌、类型相一致或者是同类同档次的替代品,后者需征得用户方管理人员同意。如须增加非投标方的货物和配件,投标方应协助解决





3


其他


到货后一周内完成安装并培训





(一)免费保修期外售后服务条款偏离表


1







2







……







(三)其他商务条款偏离表


1


关于交货


1.1签订合同后 180 天(日历日)内。






1.2投标人必须承担的设备运输、安装调试、验收检测和提供设备操作说明书、图纸等其他类似的义务。





2


关于验收


2.1投标人货物经过双方检验认可后,签署验收报告,产品保修期自验收合格之日起算,由投标人提供产品保修文件。






2.2当满足以下条件时,采购人才向中标人签发货物验收报告:


a、中标人已按照合同规定提供了全部产品及完整的技术资料。


b、货物符合招标文件技术规格书的要求,性能满足要求。


c、货物具备产品合格证。





3


付款方式


合同签订且收到发票后支付合同总价的30%为预付款;货到指定地点后且安装验收合格后支付合同总价的70%。


注:开具正规发票即可,对发票种类无特殊要求。





说明:请根据所填的“商务需求”详细填写下表的“序号”、“目录”、“招标商务条款”方面的内容





联系人:郝工
电话:010-68960698
邮箱:1049263697@qq.com

标签: 仪器 测序 生物

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