华中农业大学斑马鱼的HI-C互作数据采集和分析技术开发项目结果公告

华中农业大学斑马鱼的HI-C互作数据采集和分析技术开发项目结果公告

项目名称:华中农业大学斑马鱼的HI-C互作数据采集和分析技术开发

采购联系人:高泽霞

采购单位:水产学院

华中农业大学斑马鱼的HI-C互作数据采集和分析技术开发项目经过磋商谈判,结果公告如下:

成交价格:人民币壹拾叁万捌仟元整(¥138,000.00)

采购内容:

序号

货物名称

数量

技术指标

成交供应商

成交金额

1

华中农业大学斑马鱼的HI-C互作数据采集和分析技术开发

1项

日产能高达6TB,全天候提供高质量数据;4联芯片平台(有效READS数/芯片可5000M),支持PE150和PE100不同读长并行测序 (1)文库指标:valid pairs/unique mapped pairs >65% (2)投标单位自2018年以来(以合同签订时间为准)同类项目大于100;其相关成果发表在Nature、Cell等知名期刊;以上传的文章发表证明文件为准,且作者包含投标人单位信息; (3)投标单位自2020-2021年间曾有在Nature、Cell等知名期刊发文,以上传的文章发表证明文件为准,且文章中(实验方法/致谢)有投标人单位信息; (4)项目周期自招标完成后35个自然日内交付项目结题报告; 项目建设内容: 对斑马鱼的组织样品进行高通量染色体构像捕获(Hi-C),采用T7测序平台(PE150模式)完成DNA互作信息采集。每个样品构建2个Hi-C文库,每个Hi-C文库测序200Gb,即每个样本的总测序量为400Gb Raw data。分辨率至少达到10 kb,然后进行如下分析: (一)数据质控比对、互作矩阵构建 (二)Compartment结构分析 (三)Topologically associated domain (TAD) 结构分析 (四)显著互作位点分析(Loops); (五)FIRE(Frequently Interacting Regions)检测; (六)样本间互作差异分析; (七)与ATAC、RNA联合分析及个性化挖掘

武汉菲沙基因信息有限公

******.00

公告期限:自发布之日起公告期限为1个工作日。

如对上述成交结果存在疑问,请在有效的质疑期内以实名书面(包括联系人、地址、联系电话)形式将意见反馈至采购与招标中心。

联系电话:027-********,邮箱:hncgzb@mail.hzau.edu.cn

采购与招标中心

2022年03月21日


联系人:郝工
电话:010-68960698
邮箱:1049263697@qq.com

标签: 技术开发 农业大学 斑马鱼

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