分子动力学计算模拟平台(GY202201742)自购结果公示
分子动力学计算模拟平台(GY202201742)自购结果公示
供应商: | 艮泰(广东)科技发展有限公司 |
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中标金额: | ***** |
公示开始日期 | 2022-06-05 | 公示截止日期 | 2022-06-06 11:23:57 |
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采购单位 | 能源与动力工程学院 | 付款方式 | 签订合同后付50%,货到验收合格后付50% |
签约时间要求 | 到货时间要求 | ||
收货地址 | 山东大学千佛山校区 |
采购物品 | 采购数量 | 计量单位 |
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分子动力学计算模拟平台 | 1 | 台 |
品牌 | 艮泰 | 规格型号 | GTS2-RIS228G |
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技术参数 | 服务与技术支持提供MPI并行计算环境、浮点计算数学库及相关编译工具。提供网络文件系统和并行计算系统设置及维护。提供网络安全、系统配置服务。提供系统管理、系统使用培训,包括开关机系统、文件系统维护、文件系统结构、常规Linux使用介绍等。为用户安装其他软件提供技术支持及相关服务。为用户提供相关设备升级、扩容服务。为用户提供已有设备的网络搭建工作。提供24小时内技术响应。系统及相关运行环境操作系统 预装linux64位操作系统科学计算库 BLAS、ATLAS、LAPCK、SclaLAPCK、FFTW高性能编译器 GCC、G77、GFortran等高性能编译器并行环境 MPICH2 等并行计算环境软件开发环境 支持C、C++ 、Fortran、Python、Java等编译环境,如Eclipse,QT4,OpenGL,TclTk,Gnome等等其它软件 办公套件(包含字处理、电子表格、演示文稿和绘图等组件),专业图形图像处理软件,邮件系统等分子动力学计算模拟平台大型通用数值计算环境包含有1700多个用于工程和科学应用的数学函数。有一个高级的编程语言允许访问高级数据结构,2D和3D图形函数。包括几大主要功能:1.数学与仿真:用于常用的工程和科学应用,包括数学运算和数据分析;2.2D和3D可视化:图形函数可视化,注释和输出数据,以及很多方式可以创建和自定义各种类型的图和图表;3.优化:解决约束和非约束的连续和离散优化问题的算法;4.统计:执行数据分析和建模的工具;5.控制系统设计与分析:用于控制系统研究的标准算法和工具;6.信号处理:时域和频域信号的可视化,分析和过滤;7.应用程序开发:增加原生功能和管理与外部工具的数据交换;8.Xcos – 混合动态系统建模工具和仿真器:可进行机械系统,数字电路,液压回路和控制系统建模等。分子动力学计算模拟平台 提供分子动力学计算模拟环境,可以模拟液体中的粒子、固体和气体的系综,支持多种势函数,可采用不同的力场和边界条件模拟全原子、聚合物、生物、金属、粒状和粗斜化体系,可以计算的体系小至几个粒子,大到上百万甚至上亿个粒子。支持多种粒子和模拟类型以及力场;支持多种系综、约束条件、边界条件;提供一系列的数据预处理和后处理工具。支持并行运行,具有高度可移植的C++,含MPI库和单处理器的FFT库,支持GPU(CUDA和OpenGL)和OpenMP并行计算,可以从一个脚本同时运行一个或多个模拟(并行),作为库来构建,通过库接口提供Python的封装调用,可与其它代码相互调用。提供基于第一性原理分子动力学方法,采用赝势、平面波基矢和密度泛函理论(DFT)对原子(分子)间作用力进行计算的并行环境。其主要特性是:能运行在不同的计算机架构中,而且能够很好地并行运行;具有规范保护或超软赝势的工程;具有LDA、LSD和普遍的梯度修正方案;可实现自由能密度泛函;具有隔离系统和具有周期性边界条件的系统;分子与晶体的对称性;可进行波函数的优化、直接最小化和对角化、几何优化、分子动力学模拟(恒定能量,恒温,恒压)、路径积分分子动力学、响应函数、电子性质的计算;密度泛函理论(激发态,激发态分子动力学)计算、粗细粒度的非Markovian元动力学分析。提供用于进行固态、液态、分子和生物体系的原子和分子模拟环境,使用具有一个用于不同方式(如高斯基和平面波混合基组、经典的成对和多体势的密度泛函理论)的总体框架,使用Fortran95语言编写而且能够有效的并行执行。提供用于高效、准确的DFT计算(如液体、晶体、蛋白质对接这类的复杂系统)的先进方法,无论是用于静态属性计算还是用于动力学性质分析都是可行的。该环境下提供基于Kohn-Sham矩阵和密度矩阵的矩阵表示形式,随着系统规模的增加而变得逐渐分散,可利用线性标度方法进行密度矩阵的优化;除此之外提供基于BornOppenheimer法的从头计算分子动力学模拟环境,是可执行的且可高效利用的一个密度矩阵推断方案。数据分析与绘图环境 科学数据分析和2D/3D绘图工具,可以对数据进行平滑、各种曲线的拟合、绘图等操作,支持多种图形输出格式,交互式图形用户界面,易于快速入门。艮泰?分子动力学计算模拟平台外观 机架式CPU 2颗Intel Xeon Scalable Gold 6330 正式版 CPU ,Ice Lake架构,单颗28 Core,56Thread,2.0 GHz, Turbo 3.1 GHz,42 MB L3 Intel Smart Cache平台准系统 基于艮泰GTS2-TIS2000/GTS2-RIS2000系列,支持2颗Intel Xeon Scalable系列处理器;集成 DDR4 内存控制器;支持多种PCI-E 扩展接口;支持多个SATA3 6Gbps硬盘驱动器接口,支持RAID 0,1,5,10;集成高速USB接口;ACPI 4.0高级电源管理接口;高稳定性电源系统,主动式PFC,100-240V全电压宽幅输入,90%转换效率内存 256GB DDR4 RECC Shared Memory,速度快、安全性高、稳定性好,适用于中高端服务器及图形工作站显卡 Nvidia GeForce RTX 3080 显卡,Ampere架构,10GB GDDR6X 显示存储,8704个CUDA并行计算处理核心硬盘 4TB 固态硬盘存储数据交换机 8口全千兆以太网交换机监视器 21.5英寸监视器键鼠 计算系统即插即用USB连接光电键鼠套装 | ||
售后服务 | 服务网点:不限;质保期限:3年;响应期限:报修后24小时; |
资产与实验室管理部
2022-06-05
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