大连医科大学附属第二医院肺癌诊疗体系系列研究测序服务采购结果公告

大连医科大学附属第二医院肺癌诊疗体系系列研究测序服务采购结果公告

公告信息
公告标题:大连医科大学附属第二医院肺癌诊疗体系系列研究测序服务采购结果公告 有效期:2023-01-19 至 2023-01-20
撰写单位:大连市机电设备招标有限责任公司 撰写人:韩广鑫
中标(成交)结果公告
大连医科大学附属第二医院肺癌诊疗体系系列研究测序服务采购中标(成交)结果公告

一、项目编号:JH22-******-*****

二、项目名称:大连医科大学附属第二医院肺癌诊疗体系系列研究测序服务采购

三、中标(成交)信息

包组编号:001

包组名称:肺癌诊疗体系系列研究测序

供应商名称:北京百迈客生物科技有限公司

供应商地址:顺义区北京市顺义区南法信镇顺平路南法信段9号院1幢6层605A

中标(成交)金额:1,160,000(元)

四、主要标的信息

包组编号:001

包组名称:肺癌诊疗体系系列研究测序

服务类

名称:大连医科大学附属第二医院肺癌诊疗体系系列研究测序服务采购(C********基础医学研究服务)

服务范围:按照采购人要求进行肠道菌群宏基因组和非靶代谢组测序服务。具体包括: 1、基于Illumina Novaseq二代测序平台开展肠道微生物的宏基因组测序与分析,包含粪便基因组DNA的抽提、质检、建库、测序和分析;主要目的在于研究肠道微生物物种组成,功能组成,物种多样性与功能多样性等,每个样本至少提供6 Gb测序数据(raw data)。 2、基于LC-MS或GC-MS检测平台,利用非靶向代谢组技术检测样本代谢物,主要目的在于研究代谢物的组成,代谢物丰度和差异代谢物鉴定等。 3、基于宏基因组数据和非靶向代谢组完成联合分析,主要目的在于寻找微生物与代谢物的相关性。

服务要求:(一)、宏基因组测序: 1、服务内容: 样品检测合格后,构建DNA文库进行建库测序,并获得测序数据。采取以下技术路线进行宏基因组测序分析:样品制备――NovaSeq上机测序――生物信息数据分析。 2、服务验收方式: (1) 每个样本至少提供6 Gb测序数据(raw data)。 (2) 最终由乙方提交给甲方项目测序数据(fastq或fasta格式),提交所有原始数据、质控后数据分析结果及项目结题报告。 (3) 结题报告包括测序文库构建流程、接头序列、数据过滤指标等;如甲方委托乙方进行数据分析,乙方亦需提供详细的数据分析方法、参数,以及结果。 (4) 如甲方提供的样品达到乙方上机测序的要求,乙方测序并质控后的有效数据则必须达到合同要求。 (5) 需要提供双方签字确认的送检清单。 (6) 数据交付时间符合合同要求。如无特殊缘由,数据交付时间超过部分不得大于拟定周期的1/5,否则乙方需对甲方因此造成的项目延期进行相应的赔付。 (7) 数据交付方式符合合同要求。 (二)、非靶向代谢组检测分析: 1、服务内容: 乙方采取以下技术路线进行非靶向代谢组分析:使用Water Q-TOF 等主流试验仪器检测,实验检测在ISO 9001认证或CNAS认证实验室操作;正负离子两种模式全部检测;检测过程中包含空白样品、QC样品;检测过程中不低于5种同位素内标作为质控。样品检测合格后采取以下技术路线进行建库和数据采集:样品制备――数据采集――代谢物鉴定。最终提交代谢组(非靶向)数据和项目结题报告。 2、服务验收方式: (1) 提供项目所有原始数据raw和分析结果; (2) 提供代谢组(非靶向)数据和项目结题报告 (三)、宏基因组和非靶向代谢组联合分析,基于宏基因组数据和非靶向代谢组完成联合分析: 1、服务内容:基于宏基因组数据和非靶向代谢组完成联合分析,完成联合分析标准内容 2、服务验收方式: (1) 提供联合分析生物云权限; (2) 提供联合分析结题报告。

服务时间:技术服务期限:3个月 合同期限:自签订之日起一年乙方能够满足甲方合同的要求,双方无任何异议情况下,可以续签两年。

服务标准:1、服务地点:大连医科大学附属第二医院指定地点。 2、质量要求: (1)肠道菌群宏基因组测序分析: 宏基因组DNA提取、质检及建库:针对提供粪便样本进行DNA提取,通过凝胶电泳检测提供检测报告。然后通过将DNA进行片段化,打断为约300bp的片段,进行Illumina二代文库构建,样本建库合格率需在98%以上;选择多款主流数据库进行注释分析,包括Nr、Go、KEGG、eggNOG、Pfam、SwissProt、CAZy、CARD、VFDB、PHI-base等。 (2)非靶向代谢组检测分析: 代谢物提取检测,利用非靶向代谢组技术检测样本代谢物。包括样品制备,数据采集,分析鉴定。使用Waters Progenesis QI主流的代谢组学搜库软件进行搜库(代谢公共数据库HMDB、Metlin、Lipidmaps、KEGG数据库、微生物数据库),匹配二级谱图库进行物质定性,同时进行代谢物溯源工作。数据库含保留时间、一级精确质量和二级图谱的数据库)。 3、质保要求:2年云平台数据挖掘功能使用权限; 4、售后要求:甲方可以在分析完成日后的2年内针对原有数据、结果、分析方法等方面的疑问咨询乙方,乙方在一个月内给甲方提供整理分析类服务,二年内提供问题解答服务,咨询范围只限于合同中的服务内容。 5、其他要求: (1) 供应商需提供宏基因组生物信息分析云平台,代谢组分析平台,联合分析云使用权限; (2) 供应商需提供生物云个性化分析分析权限; (3) 供应商需指定相应技术人员对项目做售前售后的技术指导及支持; (4) 技术咨询和售后服务响应时间应小于24小时; (5) 供应商承诺数据保存时间不少于三个月; (6) 自最终验收合格、签署验收合格证书并办理移交手续之日起提供不少于12个月的售后服务: (7) 服务方需根据课题组需求提供优质的售后服务,及时响应并解决整个项目过程出现的问题,同时提供测序数据解读等相关培训,配合课题组进行后期样本回溯。具有良好的后期服务、质量保证方案。 6、验收标准及方法:本项目采购人及其委托的采购代理机构将严格按照政府采购相关法律法规以及《辽宁省政府采购履约验收管理办法》(辽财采〔2017〕603号)的要求进行验收。

五、评审专家(单一来源采购人员)名单: 赵锡钢、侯艺 

六、代理服务收费标准及金额:

包组编号:001

包组名称:肺癌诊疗体系系列研究测序

代理服务收费标准及金额:本项目参照国家发展计划委员会发布的《招标代理服务收费管理暂行办法》(计价格[2002]1980号)执行,以成交金额为基数,按服务招标标准向成交人收取代理服务费金额16,280.00(元)

 

七、公告期限

自本公告发布之日起1个工作日。

八、其他补充事宜

九、凡对本次公告内容提出询问,请按以下方式联系。

1.采购人信息

名称:大连医科大学附属第二医院            

地址:大连市沙河口区中山路467号              

联系方式:0411-********-7308          

2.采购代理机构信息

名称:大连市机电设备招标有限责任公司          

地址:大连市沙河口区长兴街2-5号           

联系方式:0411-********         

3.项目联系方式

项目联系人:韩广鑫           

电 话:0411-********

十、附件

采购文件:磋商采购文件定版-肺癌诊疗体系系列研究测序.doc

1.中小企业声明函:中小企业声明函.jpg

关联计划
附件:

标签: 测序 研究

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