多样性实验土壤真菌和细菌高通量测序服务（ZXCG-JJ-230019）成交结果公告
多样性实验土壤真菌和细菌高通量测序服务（ZXCG-JJ-230019）成交结果公告
| 项目名称 | 多样性实验土壤真菌和细菌高通量测序服务 | 项目编号 | ZXCG-JJ-****** |
|---|---|---|---|
| 公告开始日期 | 167*****28000 | 公告截止日期 | 167*****00000 |
| 采购单位 | 福建师范大学 | 付款方式 | 服务完成付清全款 |
| 联系人 | 中标后在我参与的项目中查看 | 联系电话 | 中标后在我参与的项目中查看 |
| 签约时间要求 | 成交后5日内 | 到货时间要求 | 成交后20个工作日内 |
| 预 算 | *****.0 | ||
| 收货地址 | 福建师范大学地理科学学院 | ||
| 供应商资质要求 | 符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商基本条件 | ||
| 采购商品 | 采购数量 | 计量单位 | 所属分类 |
|---|---|---|---|
| 土壤真菌ITS扩增子测序 | 110 | 个 | 其他自然科学研究和试验开发服务 |
| 品牌 | 无 |
|---|---|
| 型号 | 无 |
| 品牌2 | 无 |
| 型号 | 无 |
| 品牌3 | 无 |
| 型号 | 无 |
| 预算 | 165.0 |
| 技术参数及配置要求 | 1.样本：由DNA提取试剂盒提取获得高质量基因组DNA，DNA总量>1μg，OD260/OD280大于1.5且小于2.2，无明显降解。2.扩增区域：根据招标方需求进行真菌、细菌相应区域扩增。3.文库构建：根据标准SOP建库流程进行扩增子pcr-free文库构建。4.测序平台：使用PE250测序策略，二代测序平台NovaSeq6000进行测序。5.数据质量：原始下机数据测序质量要求:Q20≥90%，Q30≥85%。6.数据量：每个样品≥5万rawreads。7.数据质控：下机数据拆分、过滤，reads拼接、tags过滤、去嵌合体得到高质量的16S和ITS序列。8.生物信息学分析内容：8.1物种注释采用QIIME2的classify-sklearn算法对每个ASV使用预先训练好的NaiveBayes分类器进行物种注释。注释结果交互式展示，基于ASV的Venn图和花瓣图、物种相对丰度展示、物种丰度聚类热图(heatmap图)、三元相图（Ternaryplot）、属水平物种进化树。8.2样品复杂度分析8.2.1单个样品复杂度分析Alpha多样性、Alpha多样性稀释曲线图、组间样本Alpha多样性指数盒形图与差异检验，Alpha多样性分析指数包含：observed_otus、shannon、simpson、chao1、goods_coverage、dominance和pielou_e；8.2.2样品间复杂度比较分析Beta多样性指数组间差异分析，多变量统计学方法主成分分析（PCA，PrincipalComponentAnalysis），主坐标分析（PCoA，PrincipalCo-ordinatesAnalysis）以及无度量多维标定法（NMDS，Non-MetricMulti-DimensionalScaling）。9.组间群落结构差异显著性检验（组别≥2，每组样品数≥3）通过Adonis和Anosim分析方法中的Weighted_unifrac和Unweighted_unifrac距离分析组间群落结构差异性是否显著。10.物种差异分析针对有分组的项目，通过T-test、MetaStat、LEfSe(LDAEffectSize)、随机森林等统计分析，可以有针对性的找出组间丰度变化差异显著的物种，并得到差异物种在不同分组内的富集情况。11.功能预测根据招标方需求及样本情况利用PICRUSt2、Tax4Fun、BugBase、FunGuild等工具进行功能预测。12.环境因子关联分析对于有环境因子数据的样本，进行Spearman相关性、Manteltest、CCA/RDA、dbRDA、VPA分析展示菌群与环境因子的关系。13.结果报告:1)结题报告；2)结果文件；3)赠送一次免费分析服务；4)赠送微生物云平台数据挖掘服务。14.样品、数据保存和递送：14.1中标人需提供样品邮寄过程中所产生的邮费、干冰等耗材支出，未完成结果分析前需对样品进行有效保存；14.2中标人需提供数据转移过程所需硬盘，并负责拷贝数据送至指定地点。15.硬件要求：投标方需拥有智能化交付平台Falcon，并搭载自动化样本库，以确保项目能高效准确智能化的开展。16.服务时间需要在20天内完成数据交接。 |
| 售后服务 | 赠送一次免费分析服务；赠送微生物云平台数据挖掘服务; |
| 采购商品 | 采购数量 | 计量单位 | 所属分类 |
|---|---|---|---|
| 土壤细菌16S扩增子测序 | 110 | 个 | 其他自然科学研究和试验开发服务 |
| 品牌 | 无 |
|---|---|
| 型号 | 无 |
| 品牌2 | 无 |
| 型号 | 无 |
| 品牌3 | 无 |
| 型号 | 无 |
| 预算 | 165.0 |
| 技术参数及配置要求 | 1.样本：由DNA提取试剂盒提取获得高质量基因组DNA，DNA总量>1μg，OD260/OD280大于1.5且小于2.2，无明显降解。2.扩增区域：根据招标方需求进行真菌、细菌相应区域扩增。3.文库构建：根据标准SOP建库流程进行扩增子pcr-free文库构建。4.测序平台：使用PE250测序策略，二代测序平台NovaSeq6000进行测序。5.数据质量：原始下机数据测序质量要求:Q20≥90%，Q30≥85%。6.数据量：每个样品≥5万rawreads。7.数据质控：下机数据拆分、过滤，reads拼接、tags过滤、去嵌合体得到高质量的16S和ITS序列。8.生物信息学分析内容：8.1物种注释采用QIIME2的classify-sklearn算法对每个ASV使用预先训练好的NaiveBayes分类器进行物种注释。注释结果交互式展示，基于ASV的Venn图和花瓣图、物种相对丰度展示、物种丰度聚类热图(heatmap图)、三元相图（Ternaryplot）、属水平物种进化树。8.2样品复杂度分析8.2.1单个样品复杂度分析Alpha多样性、Alpha多样性稀释曲线图、组间样本Alpha多样性指数盒形图与差异检验，Alpha多样性分析指数包含：observed_otus、shannon、simpson、chao1、goods_coverage、dominance和pielou_e；8.2.2样品间复杂度比较分析Beta多样性指数组间差异分析，多变量统计学方法主成分分析（PCA，PrincipalComponentAnalysis），主坐标分析（PCoA，PrincipalCo-ordinatesAnalysis）以及无度量多维标定法（NMDS，Non-MetricMulti-DimensionalScaling）。9.组间群落结构差异显著性检验（组别≥2，每组样品数≥3）通过Adonis和Anosim分析方法中的Weighted_unifrac和Unweighted_unifrac距离分析组间群落结构差异性是否显著。10.物种差异分析针对有分组的项目，通过T-test、MetaStat、LEfSe(LDAEffectSize)、随机森林等统计分析，可以有针对性的找出组间丰度变化差异显著的物种，并得到差异物种在不同分组内的富集情况。11.功能预测根据招标方需求及样本情况利用PICRUSt2、Tax4Fun、BugBase、FunGuild等工具进行功能预测。12.环境因子关联分析对于有环境因子数据的样本，进行Spearman相关性、Manteltest、CCA/RDA、dbRDA、VPA分析展示菌群与环境因子的关系。13. 结果报告:1)结题报告；2)结果文件；3)赠送一次免费分析服务；4)赠送微生物云平台数据挖掘服务。14.样品、数据保存和递送：14.1中标人需提供样品邮寄过程中所产生的邮费、干冰等耗材支出，未完成结果分析前需对样品进行有效保存；14.2中标人需提供数据转移过程所需硬盘，并负责拷贝数据送至指定地点。15.硬件要求：投标方需拥有智能化交付平台Falcon，并搭载自动化样本库，以确保项目能高效准确智能化的开展。16.服务时间需要在20天内完成数据交接。 |
| 售后服务 | 赠送一次免费分析服务；赠送微生物云平台数据挖掘服务; |
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