项目名称

2024年基于多组学对海南地方猪遗传资源的评估项目，用于测试分析服务。

成交供应商名称及地址

名称：北京诺禾致源科技股份有限公司

地址：北京市昌平区回龙观镇生命园路29号创新大厦B258室

成交标的物名称

测试分析服务

成交金额（元）

*****.00

数量

1.完成至少12份组织样品转录组测序

2.完成至少100份微生物组（宏基因组）测序

规格要求

1. 转录组测序（采用Illumina平台、PE150测序策略，产出数据至少6G/样本，Q30大于90%），并提供正式测序分析报告1份，包括质控、数据产出统计及质量评估、参考序列比对分析（含基因组结构注释文件和功能注释文件）、可变剪切分析、新转录本预测、SNP/InDel分析、基因表达水平分析、样本间基因表达水平的相关性分析、主成分分析、基因差异表达分析、差异表达基因的GO、KEGG富集分析、差异表达基因的蛋白质互作网络分析、差异表达基因中的转录因子鉴定、WGCNA、GSEA等：

2. 微生物组（宏基因组）测序（采用Illumina平台、PE150测序策略，产出数据至少10G/样本，Q30大于90%），并提供正式测序分析报告1份，包括质控、宿主过滤、各样品Metagenome组装、基因预测及丰度分析（gene catalogue基本信息统计、core-pan 基因分析、基因数目差异分析及样品间相关性分析）、物种注释及统计（物种相对丰度概况、注释基因数目及相对丰度聚类分析、基于物种丰度的降维分析及Anosim分析、基于物种丰度的样品聚类分析及Random Forest分析、组间差异物种的Metastat及LEfSe分析）、常用功能数据库注释（KEGG、eggNOG、CAZy等）、抗性基因注释（抗性基因丰度概况、抗性基因类型的分布及丰度聚类分析、基于抗性基因丰度的Anosim分析、组间抗性基因数目差异分析、 组间差异抗性基因的Metastat及Lefse分析、抗性基因与物种归属关系）等。

服务要求

以签订的正式合同内容为准