一套三倍体基因组组装挂载注释及泛基因组分析成交结果公告

招 标 正 文
 

一套三倍体基因组组装挂载注释及泛基因组分析成交结果公告


成交供应商：武汉碳码生物科技有限公司

成交金额：*****.0

成交理由：符合要求，价格最低
项目名称 一套三倍体基因组组装挂载注释及泛基因组分析 项目编号 EJWJ*******
公告开始日期 172*****68000 公告截止日期 172*****00000
采购单位 福建农林大学 付款方式 货到验收付款
联系人 中标后在我参与的项目中查看 联系电话 中标后在我参与的项目中查看
签约时间要求 成交后7日内 到货时间要求 无
预 算 *****.0
收货地址 无
供应商资质要求

符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商基本条件
采购商品 采购数量 计量单位 所属分类
一套三倍体基因组组装挂载注释及泛基因组分析 1 套 农学研究服务
品牌 无
型号 无
品牌2 无
型号 无
品牌3 无
型号 无
预算 *****.0
技术参数及配置要求 一、（三倍体基因组分型）基因组组装： 1.原始数据进行去除接头、污染序列及低质量 reads 的处理； 2.数据产出统计及数据的成分和质量评估； 3. 基因组组装： 3.1组装； 3.2组装结果校正； 3.3组装结果统计； 3.4基因组覆盖度评估； 3.5基因组准确性评估 3.6基因组完整性评估（BUSCO) 二、（三倍体基因组分型）Hi-C辅助染色体挂载： 1.原始数据质控； 2.数据产出统计； 3.与参考基因组比对及数据过滤； 4.染色体构建； 5. 结果准确性评估及校正； 6. BUSCO评估。 三、（三倍体基因组）基因组注释： 1.1重复序列的识别；（Tandem repeat、Interspersed repeat） 1.2非编码RNA的预测；(rRNA，tRNA，snRNA，miRNA) 1.3基因结构预测； 1.4基因功能注释（NR、Swiss-prot、Interpro、KEGG、Trembl）； 1.5注释结果评估； 1.6绘制基因组圈图（基因密度、重复序列占比、GC含量） 四、泛基因组分析（11组基因组相比较）： 1.1核心基因和非核心基因分析 1.2 SNP、InDel检测与注释 1.3 SV、CNV检测与注释 1.4 PAV检测与注释 1.5 变异信息的图形化展示（Circos图） 1.6 泛 SV 分析 1.6.1 泛 SV 分类 1.6.2 重复序列含量分析
售后服务 无

标签: 分析

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