跨物种单细胞检索库成交结果公告
跨物种单细胞检索库成交结果公告
项目名称 | 跨物种单细胞Embedding检索库 | 项目编号 | ZJLAB-FS-BX# |
---|---|---|---|
公告开始日期 | # | 公告截止日期 | # |
采购单位 | 之江实验室 | 付款方式 | 自合同签署后3个工作日,向#方支付40%,自中期验收后3个工作日,向#方支付40%,自验收合格后,向#方支付20% |
联系人 | 中标后在我参与的项目中查看 | 联系电话 | 中标后在我参与的项目中查看 |
签约时间要求 | 无 | 到货时间要求 | 无 |
预 算 | #.0 | ||
收货地址 | 无 | ||
供应商资质要求 | 符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商基本条件 |
采购商品 | 采购数量 | 计量单位 | 所属分类 |
---|---|---|---|
跨物种单细胞Embedding检索库 | 1 | 项 | 计算机科学技术研究服务 |
品牌 | 无 |
---|---|
型号 | 无 |
品牌2 | 无 |
型号 | 无 |
品牌3 | 无 |
型号 | 无 |
预算 | #.0 |
技术参数及配置要求 | 单细胞Embedding数据入库 需求说明: ? 数据格式化:来自之江实验室的跨物种单细胞embedding数据需经过严格的标 (略) 理, (略) 存储规范。格式化过程涉及数据表结构、字段定义和表达量矩阵的格式统一,确保数据在不同物种和实验条件下的可比性和一致性。 ? 数据标准化:入库前对单细胞基因表达数据进行 (略) 理,包括去除低质量细胞、填充缺失值、以及基因表达的Z-score标准化,确保数据具有良好的统计性质,且便于后续下游分析。 ? 元数据管理:每份单细胞数据需要附带详细的元数据(Metadata),包括但不限于样本来源、物种信息、实验条件、细胞类型、细胞状态、批次效应等,以确保数据能够在复杂的生物学背景下得到准确标注和查询。 ? 数据存储方案:设计高效、可扩展的存储架构,支持大规模单细胞数据(如高维度基因表达矩阵、细胞注释信息等)的存储。平台应支持分布式存储系统和基于NoSQL数据库的高效数据访问策略,确保在多维度数据查询时的低延迟和高吞吐量。 2. 平台开发与接口支持 需求说明: ? 平台架构设计:开发具有高度 (略) 架构, (略) 理大规模单细胞数据的高效查询、动态展示与数据下载。平台应具备强大 (略) 理能力,能够支持大规模用户访问和高效的多维度数据检索。 ? 用户友好性:平台需设计直观的用户界面,科研人员可以不受编程背景的限制,快速上手并进行数据查询。数据界面应支持基因表达模式、细胞亚群的可视化,并允许用户对不同实验组进行直观对比。 ? 多物种数据支持:平台应具备跨物种的单细胞数据整合和查询能力。用户能够根据不同的物种、细胞类型、基因表达模式等多维度信息进行筛选、排序与聚类分析,以支持各类生物学研究需求。 ? 数据复用与下载:平台将提供高效的数据下载功能,用户能够基于筛选结果下载单细胞embedding数据,并支持多种数据格式(如CSV、H5、JSON等)以满足不同分析工具的兼容性要求,进一步推动科研人员的数据复用。 3. API接口开发 需求说明: ? 高效API设计:为平台提供高效的RESTful API接口,使得科研人员能够便捷地通过API远程查询和下载单细胞数据。API应支持并发请求,能够根据输入数据自动返回嵌入式推理结果和元数据信息。 ? 支持自动化调用:API接口需支持批量查询 (略) 理,科研人员可以通过脚本自动化调用,轻松完成大规模数据的批量分析任务。 ? 多格式数据支持:API接口需支持多种数据格式(如CSV、JSON、H5等),并具备数据格式转换功能,能够根据用户请求提供符合要求的embedding结果。 4. 模型的部署与推理 需求说明: ? 模型部署:将基于深度学台需具备自动化的推理任务调度系统,能够根据推理任务的规模与复杂性自动分配计算资源,并进行负载均衡,保证推理过程的高效与可靠性。 ? 推理结果管理:推理任务产生的单细胞embedding数据将实时存储并与原始数据一同提供。所有推理过程中的中间结果、日志和元数据都需被保留,以支持进一步的回溯分析和推理结果的验证。 5. 单细胞标注信息管理 需求说明: ? 标注信息管理系统:构建一个完整的标注信息管理框架,对每个单细胞数据点进行详细的标注。标注内容包括物种、细胞类型、细胞状态、实验条件、采样时间等信息,以帮助科研人员深入挖掘数据的生物学意义。 ? 标注信息更新与维护:平台需支持标注信息的动态更新与维护,确保新进数据或新的实验结果能够及时反映到标注信息中,保证数据的一致性和时效性。 ? 标注信息查询与筛选:科研人员可根据标注信息(如物种、细胞类型、实验组等)进行灵活查询与筛选,确保在进行复杂生物学分析时能够快速定位和检索到所需的数据。 验收标准 (略) 质量和功能符合项目要求,#方需满足以下验收标准: 1. 性能标准 支持高通量向量检索,在百万级细胞数的向量库中,系统仍需稳定运行,检索响应时间≤5秒。 2. 功能标准 向量检索功能需实现,确保用户基于输入或上传的向量进行相似性检索,结果向量的高相似度匹配。 在多物种单细胞向量检索测试集中,Positive组检索匹配率不低于90%。Negtive组中,检索匹配率不高于1%。 3. 系统稳定性与安全性 平台在高并发情况下应无宕机、卡顿,关键功能(检索、保存、导出等)应无异常或重大缺陷。 数据传输安全:敏感数据需加密,防止篡改或丢失,平台应具备防止SQL注入、DDOS攻击等安全防护措施。 4. 用户体验 界面简洁易用,功能操作流程清晰,界面加载时间≤3秒。用户可顺利完成检索、筛选、导出等操作。 平台的**分析工具(聚类、降维等)**需操作便捷,分析结果可视化准确,并支持导出图表。 5. 文档与技术支持 提供详细的技术文档,包括架构设计、功能模块说明、操作手册,确保#方顺利部署、使用、 (略) 。 验收期间提供必要的技术支持, (略) 稳定运行并解决任何技术问题。 服务内容交付时间: 项目服务交付分三阶段: 1. 签约后3个工作日: 目标:明确项目要求,完成系统架构设计和开发计划。 交付内容:项目需求确认、#方提交总体架构设计方案。 2. 签约后40个工作日: 目标:完成核心功能模块开发与初步测试,交付可运行系统原型。 交付内容:可运行系统原型代码,以及含功能开发、架构实现、 (略) 理相关内容及提交阶段性技术文档。 交付标准:交付完整可部署的原型代码,支持不低于#细胞数的简单向量检索。 3. 签约后 100个工作日完成。 目标:完成全部功能开发及优化,全面测试并交付最终产品。 交付内容:涵盖功能模块开发调试、工具集成测试、数据相关功能完成以及提交完整文档和部署系统等。 交付标准:系统在真实、高并发场景稳定运行,各功能模块无明显缺陷及性能问题,在测试集上满足正负样本数据集的检索准确率要求。 |
售后服务 | 交付后一个月内7*12小时部署技术支持; |
项目名称 | 跨物种单细胞Embedding检索库 | 项目编号 | ZJLAB-FS-BX# |
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公告开始日期 | # | 公告截止日期 | # |
采购单位 | 之江实验室 | 付款方式 | 自合同签署后3个工作日,向#方支付40%,自中期验收后3个工作日,向#方支付40%,自验收合格后,向#方支付20% |
联系人 | 中标后在我参与的项目中查看 | 联系电话 | 中标后在我参与的项目中查看 |
签约时间要求 | 无 | 到货时间要求 | 无 |
预 算 | #.0 | ||
收货地址 | 无 | ||
供应商资质要求 | 符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商基本条件 |
采购商品 | 采购数量 | 计量单位 | 所属分类 |
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跨物种单细胞Embedding检索库 | 1 | 项 | 计算机科学技术研究服务 |
品牌 | 无 |
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型号 | 无 |
品牌2 | 无 |
型号 | 无 |
品牌3 | 无 |
型号 | 无 |
预算 | #.0 |
技术参数及配置要求 | 单细胞Embedding数据入库 需求说明: ? 数据格式化:来自之江实验室的跨物种单细胞embedding数据需经过严格的标 (略) 理, (略) 存储规范。格式化过程涉及数据表结构、字段定义和表达量矩阵的格式统一,确保数据在不同物种和实验条件下的可比性和一致性。 ? 数据标准化:入库前对单细胞基因表达数据进行 (略) 理,包括去除低质量细胞、填充缺失值、以及基因表达的Z-score标准化,确保数据具有良好的统计性质,且便于后续下游分析。 ? 元数据管理:每份单细胞数据需要附带详细的元数据(Metadata),包括但不限于样本来源、物种信息、实验条件、细胞类型、细胞状态、批次效应等,以确保数据能够在复杂的生物学背景下得到准确标注和查询。 ? 数据存储方案:设计高效、可扩展的存储架构,支持大规模单细胞数据(如高维度基因表达矩阵、细胞注释信息等)的存储。平台应支持分布式存储系统和基于NoSQL数据库的高效数据访问策略,确保在多维度数据查询时的低延迟和高吞吐量。 2. 平台开发与接口支持 需求说明: ? 平台架构设计:开发具有高度 (略) 架构, (略) 理大规模单细胞数据的高效查询、动态展示与数据下载。平台应具备强大 (略) 理能力,能够支持大规模用户访问和高效的多维度数据检索。 ? 用户友好性:平台需设计直观的用户界面,科研人员可以不受编程背景的限制,快速上手并进行数据查询。数据界面应支持基因表达模式、细胞亚群的可视化,并允许用户对不同实验组进行直观对比。 ? 多物种数据支持:平台应具备跨物种的单细胞数据整合和查询能力。用户能够根据不同的物种、细胞类型、基因表达模式等多维度信息进行筛选、排序与聚类分析,以支持各类生物学研究需求。 ? 数据复用与下载:平台将提供高效的数据下载功能,用户能够基于筛选结果下载单细胞embedding数据,并支持多种数据格式(如CSV、H5、JSON等)以满足不同分析工具的兼容性要求,进一步推动科研人员的数据复用。 3. API接口开发 需求说明: ? 高效API设计:为平台提供高效的RESTful API接口,使得科研人员能够便捷地通过API远程查询和下载单细胞数据。API应支持并发请求,能够根据输入数据自动返回嵌入式推理结果和元数据信息。 ? 支持自动化调用:API接口需支持批量查询 (略) 理,科研人员可以通过脚本自动化调用,轻松完成大规模数据的批量分析任务。 ? 多格式数据支持:API接口需支持多种数据格式(如CSV、JSON、H5等),并具备数据格式转换功能,能够根据用户请求提供符合要求的embedding结果。 4. 模型的部署与推理 需求说明: ? 模型部署:将基于深度学台需具备自动化的推理任务调度系统,能够根据推理任务的规模与复杂性自动分配计算资源,并进行负载均衡,保证推理过程的高效与可靠性。 ? 推理结果管理:推理任务产生的单细胞embedding数据将实时存储并与原始数据一同提供。所有推理过程中的中间结果、日志和元数据都需被保留,以支持进一步的回溯分析和推理结果的验证。 5. 单细胞标注信息管理 需求说明: ? 标注信息管理系统:构建一个完整的标注信息管理框架,对每个单细胞数据点进行详细的标注。标注内容包括物种、细胞类型、细胞状态、实验条件、采样时间等信息,以帮助科研人员深入挖掘数据的生物学意义。 ? 标注信息更新与维护:平台需支持标注信息的动态更新与维护,确保新进数据或新的实验结果能够及时反映到标注信息中,保证数据的一致性和时效性。 ? 标注信息查询与筛选:科研人员可根据标注信息(如物种、细胞类型、实验组等)进行灵活查询与筛选,确保在进行复杂生物学分析时能够快速定位和检索到所需的数据。 验收标准 (略) 质量和功能符合项目要求,#方需满足以下验收标准: 1. 性能标准 支持高通量向量检索,在百万级细胞数的向量库中,系统仍需稳定运行,检索响应时间≤5秒。 2. 功能标准 向量检索功能需实现,确保用户基于输入或上传的向量进行相似性检索,结果向量的高相似度匹配。 在多物种单细胞向量检索测试集中,Positive组检索匹配率不低于90%。Negtive组中,检索匹配率不高于1%。 3. 系统稳定性与安全性 平台在高并发情况下应无宕机、卡顿,关键功能(检索、保存、导出等)应无异常或重大缺陷。 数据传输安全:敏感数据需加密,防止篡改或丢失,平台应具备防止SQL注入、DDOS攻击等安全防护措施。 4. 用户体验 界面简洁易用,功能操作流程清晰,界面加载时间≤3秒。用户可顺利完成检索、筛选、导出等操作。 平台的**分析工具(聚类、降维等)**需操作便捷,分析结果可视化准确,并支持导出图表。 5. 文档与技术支持 提供详细的技术文档,包括架构设计、功能模块说明、操作手册,确保#方顺利部署、使用、 (略) 。 验收期间提供必要的技术支持, (略) 稳定运行并解决任何技术问题。 服务内容交付时间: 项目服务交付分三阶段: 1. 签约后3个工作日: 目标:明确项目要求,完成系统架构设计和开发计划。 交付内容:项目需求确认、#方提交总体架构设计方案。 2. 签约后40个工作日: 目标:完成核心功能模块开发与初步测试,交付可运行系统原型。 交付内容:可运行系统原型代码,以及含功能开发、架构实现、 (略) 理相关内容及提交阶段性技术文档。 交付标准:交付完整可部署的原型代码,支持不低于#细胞数的简单向量检索。 3. 签约后 100个工作日完成。 目标:完成全部功能开发及优化,全面测试并交付最终产品。 交付内容:涵盖功能模块开发调试、工具集成测试、数据相关功能完成以及提交完整文档和部署系统等。 交付标准:系统在真实、高并发场景稳定运行,各功能模块无明显缺陷及性能问题,在测试集上满足正负样本数据集的检索准确率要求。 |
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